Rui começou sua carreira como dirigente em outubro de 2012, em passagem pelo Grêmio. Ficou no clube gaúcho até maio de 2016. Durante sua passagem pelo Tricolor, o diretor foi eliminado em 11 competições em quatro anos, além de ter contratado 48 jogadores em 41 meses de trabalho. Teve cinco técnicos - Vanderlei Luxemburgo, Renato Gaúcho, Enderson Moreira, Felipão e Roger Machado.
Sete meses depois de sair do Grêmio, Rui Costa teve a dura missão de resgatar a Chapecoense logo depois do trágico acidente aéreo que vitimou vários jogadores. Com a ajuda de outros clubes, conseguiu montar um elenco competitivo e conquistou o Campeonato Catarinense. Deixou o clube em agosto de 2018 e chegou no Athletico.
Trabalhando no Furacão, Rui chegou dois meses após a demissão de Fernando Diniz, em agosto de 2018, hoje treinador do São Paulo. Mesmo tendo uma passagem curta, de apenas seis meses, participou da montagem do elenco 2019 e esteve na função durante o título da Copa Sul-Americana conquistada pelo clube.
Seu último trabalho foi no Atlético-MG, onde chegou em abril de 2019. Um mês depois, foi eleito o melhor executivo de 2018, em evento realizado no Teatro CIEE, em São Paulo. Ele obteve 42% dos votos e tinha a concorrência de Alexandre Mattos, do Palmeiras, e Marcelo Djian, do Cruzeiro.
A premiação foi respectiva ao desempenho na temporada 2018, de acordo com os resultados alcançados em relação à capacidade de investimento de cada clube na categoria diretor executivo de futebol. Rui Costa deixou a Chapecoense em julho para assumir o Athletico, que naquela ocasião estava na zona do rebaixamento do Campeonato Brasileiro. Em quase seis meses de trabalho, ajudou o clube paranaense a encerrar a competição nacional na 7a posição, e a conquistar o inédito título da Copa Sul-Americana.
No Galo, foi o responsável por trazer bons nomes no elenco, como Guilherme Arana, Maílton, Hyoran, Allan, Dylan Borrero, Savarino e Diego Tardelli. No entanto, alguns reforços, como o atacante Franco Di Santo, não tiveram bons resultados. Trouxe o venezuelano Rafael Dudamel para ser o treinador da equipe. Porém, ambos acabaram demitidos depois da eliminação do Galo para o Afogados na Copa do Brasil.
VEJA O CURRÍCULO DE RUI COSTA
Cube Atlético Mineiro
Diretor Executivo
Abril/2019 - Fevereiro/2020
Clube Athletico Paranaense
Diretor Executivo
Agosto/2018 - Janeiro/2019
Títulos
Campeão Sulamericano
Associação Chapecoense de Futebol
Diretor Executivo
Dezembr/2016 - Agosto/2018
Títulos
Campeão Catarinense
Grêmio Foot Ball Porto Alegrense
Diretor Executivo
Outubro/2012 - Maio/2016
São Paulo Fc, Tricolor, SPFC, Rui costa
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